支原体感染一般的疗程是两周，但是也要根据病情的严重程度决定治疗的疗程，当患者确诊为支原体感染时，可使用大环内酯类的抗生素或者是喹诺酮类的抗生素进行治疗。大环内酯类的抗生素包括阿奇霉素、红霉素、罗红霉素，喹诺酮类的抗生素包括左氧氟沙星、莫西沙星等等，轻者可口服给药，重症者需要静脉给药。使用上述药物时需要注意药物的副反应以及禁忌症，例如左氧氟沙星、莫西沙星18岁以下禁止使用，有癫痫病史时也是禁止使用的，大环内酯类抗生素主要的副反应是胃肠道反应。