尖锐湿疣初期，如果疣体比较小，首先，可以采取药物治疗，比如使用鬼臼毒素酊，就可以使小的疣体脱落。其次，也可以使用咪喹莫特霜，这是一种局部免疫调节剂，也能够使小的尖锐湿疣皮损消退，可能见效相对较慢一些，而且刺激性相对比较小。再次，如果是大的尖锐湿疣疣体，可以采取激光、冷冻、电离子灼烧等治疗。
最后，还可以配合一些干扰素凝胶等等来减少其复发。对于这种初期的尖锐湿疣，如果能够积极治疗，定期的复诊，每次复诊的时候做醋酸白试验，发现存在的亚临床感染并加以清除，能够比较短的时间内使其痊，在治疗期间还要注意避免酗酒和劳累。