真菌性巩膜炎表现为缓慢进展的坏死性前巩膜炎。一般起病比较慢，主要的临床表现有眼红、畏光、流泪、眼痛、视力下降和结膜囊分泌物等。检查根据病史和临床表现。如果怀疑是真菌性巩膜炎，可以进行实验室检查。实验室检查，包括角膜和巩膜刮片进行革兰染色显示真菌的形态。革兰染色的检出率一般为55%。如果角膜发生匐行性改变，有真菌性角巩膜炎的临床表现，真菌培养和巩膜或角巩膜活检阴性，对广谱抗生素治疗无效。真菌可通过完整的Descemet膜侵入前房，引起前房角积脓，角膜尚未穿孔时行前房角穿刺。