霉菌性阴道炎每个个体用药敏感性不同，每个人所用药物哪个好的快可能会不一样。总体来说，对于初次发生霉菌性阴道炎的病人，像克霉唑、制霉菌素、益康唑等制成的栓剂效果都不错。
有的还可以同时应用氟康唑或者伊曲康唑进行口服，尤其对月经期的女性，上药不太方便，容易引起感染，所以月经期感染霉菌性阴道炎可以口服氟康唑、伊曲康唑、硝呋太尔片，效果也比较好。对于反复发作的霉菌性阴道炎可能要联合用药，依据个体性一般是应用3-6个月，同时用阴道栓剂和口服抗霉菌的药物，每次都在月经干净以后3-7天进行治疗，治疗3-6个月，也就是3-6个疗程再去复查。