发生鼻旁窦癌有可能会伴有耳朵疼痛的症状，个别发生上颌窦癌的患者可能会主诉出现耳痛症状。此种耳痛大多数是阵发性疼痛，而疼痛的严重程度一般并不明显，通常认为上颌窦癌所合并耳朵疼痛的症状，常是由于出现了神经反射所引起。
更多上颌窦癌患者常是伴有头痛的症状，有时是隐痛，而有一些患者当癌肿侵入到颅内颅底时，疼痛可以非常剧烈，甚至出现辗转反侧、呻吟不止，普通的止疼药物并不能有效缓解疼痛。