目前认为核苷类药物是抗生殖器疱疹最有效的药物，对于初发的可以用阿昔洛韦200mg每日5次或者400mg每日3次口服，或者伐昔洛韦1000mg每日2次口服，或者泛昔洛韦250mg每日3次口服，疗程均为7-10天。对于复发型的可以采用间歇疗法，最好出现前驱症状或者皮损出现24小时内就开始治疗。阿昔洛韦200mg每日5次或400mg每日3次口服，或伐昔洛韦500mg每日1-2次口服，或泛昔洛韦125mg每日2次口服，疗程一般为5天。