沙眼衣原体阳性，可能意味着患有沙眼，但是细胞学的检查有一定的假阳性率。沙眼是由沙眼衣原体感染所致的慢性传染性结膜、角膜炎，可以导致失明，在20世纪50年代以前，我国曾广泛流行该病，是当时致盲的首要原因。后来随着生活水平的提高、卫生常识的普及和医疗条件的改善，发病率、并发症大大降低。
目前有的沙眼，基本上都是瘢痕化的沙眼，没有传染性。在2014年，我国已经宣布中国达到了世界卫生组织根治致盲性沙眼的要求。只要平时做好良好的卫生习惯，避免接触性的传染，改善周围的环境，基本上现在罹患沙眼的可能性非常小。