消化不良是指各种原因导致胃肠道的消化能力下降，胃肠道的消化能力可以分为物理性消化以及化学性消化。
物理性消化是指食物通过牙齿的咀嚼以及胃窦研磨变成细碎的食糜，化学性消化是指食糜经过消化酶的处理，变成分子级别的营养物质，才能被小肠消化吸收。
各种原因影响物理消化与化学消化都可以导致相应的消化不良，影响物理性消化主要包括慢性胃病、胃肠动力紊乱、胃食管反流病、胆汁反流性胃炎，这些疾病都多少影响着胃肠道动力。
而化学性消化多数是由于胆囊和胰腺来完成，所以慢性胆囊炎、慢性胰腺疾病都可以影响化学性消化。