肾结石的早期一般有三大症状：疼痛、血尿、泌尿系感染。
大概有一半的病人有间断的腰部和腹部疼痛，疼痛可以较为轻微，表现为腰部酸胀不适，但是也可以出现剧烈的疼痛，这种疼痛常常在活动后发作，表现为剧烈的绞痛，放射到下腹部、腹腹沟或者股内侧，女性则可以放射到阴唇。这种肾结石发作时，同时伴有恶心、呕吐、腹胀、便秘，胃肠道反应，不用过多担心，当疼痛消失后自然会缓解。
疼痛时往往伴发肉眼血尿或镜下血尿，以后者居多，镜下血尿是在化验尿常规时可发现潜血阳性。
有一部分病人没有明显的疼痛及血尿，而是因为泌尿系感染的症状来就医，所以如果反复出现泌尿系感染，则需要做进一步检查，如X光片、CT等。