人乳头瘤病毒39型阳性说明有病毒的感染。人乳头瘤病毒39型阳性属于低危型的病毒，这种病毒大部分可以通过自身免疫系统自动清除的。一般在一年之内可以通过自身的免疫系统清除，大部分两年之内完全可以自动清除体内的病毒。
如果检查出来有人乳头瘤39型阳性则需要进一步做TCT的检查，如果TCT检查没有问题，一年之后要重复筛查人乳头瘤病毒和TCT，如果两项均没有问题即可放心。如果还存在人乳头瘤病毒的感染，则需要进一步做宫颈活检，排除有无宫颈的病变。