血液和尿液的淀粉酶变化可用于急性胰腺炎的诊断和急腹症的鉴别诊断，由于淀粉酶半衰期短，胰腺或者腮腺发生病变时，血液中的淀粉酶增高较早，持续时间短，而尿液淀粉酶增高晚，持续时间长，但是临床上以血液淀粉酶变化为主要诊断依据，尿液淀粉酶的变化为参考。
当血尿淀粉酶增高时先是见于急性胰腺炎，也可以见于慢性胰腺炎的急性发作，胰腺癌的早期也会出现淀粉酶的增高，而非胰腺疾病当中消化性的溃疡、穿孔、上腹部手术、机械性肠梗阻、胆管梗阻、急性胆囊炎时淀粉酶也可能增高，乙醇中毒、肾衰竭、巨淀粉酶血症都会造成淀粉酶的升高，在疾病当中会出现淀粉酶的减低，如慢性胰腺炎的时候，淀粉酶减低多是因为胰腺组织严重破坏，导致胰腺分泌功能障碍，胰腺癌的时候淀粉酶减低多是因为肿瘤压迫时间过久，腺体组织纤维化，分泌功能降低，其他可见于肾衰竭的晚期和巨淀粉酶血症中部分患者尿液中的淀粉酶会降低。