生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒感染所引起，临床上可以将其分为原发性、复发性和亚临床型三种类型。原发性的生殖器疱疹是初次感染单纯疱疹病毒引起的症状，主要是通过性行为、性接触感染，主要是单纯疱疹病毒2型所引起。局部是群集性的水疱、糜烂，但是不少人合并有全身性的症状，包括发烧、乏力、全身不适等。
复发性的单纯疱疹在初次感染之后，病毒体内潜伏，机体免疫力下降的时候再次出现，往往以局部的水疱症状为主，比较少见全身的症状。另外，还有就是亚临床型的生殖器疱疹，症状往往不典型，看不到明显的水疱，只是局部有些小的糜烂面、裂隙等，容易被忽视，但是也有传染性。