肛周脓肿是肛门直肠间隙发生的急性的化脓性的感染，这个病比较常见，在炎症的初期脓肿尚没有形成的时候，可以选择抗感染的药物，口服或者静滴抗生素以控制炎症的扩散，也可以根据辩证来用清热解毒的中药。
但是如果是脓肿形成以后，肛周脓肿起病很急，可迅速发展成脓腔，所以手术治疗是本病最主要的治疗方法。建议及早切开引流，但根据情况可以行一次性的根治术，或单纯脓肿切开引流术，但是有部分的肛周脓肿会形成肛瘘，需要再择期行肛瘘的手术。