伤寒的抗生素治疗首选第三代喹诺酮类药物及第三代头孢菌素类药物，自1948年以来，氯霉素治疗伤寒已有50年的历史，曾被作为治疗伤寒的首选药物，20世纪50年代已发现耐氯霉素的伤寒菌株，有些伤寒菌株呈多重耐药性，因此，氯霉素、氨苄西林和复方磺胺甲恶唑仅用于敏感伤寒菌株的治疗。
第三代喹诺酮类药物口服吸收良好，在血液、胆汁、肠道和尿路的浓度高，能渗透进入细胞，作用于细菌DNA旋转酶影响DNA合成，发挥杀菌的药效，对氯霉素敏感的伤寒菌株，对氯霉素耐药的伤寒菌株，均有良好的抗菌活性，因此，第三代喹诺酮类药物已经成为伤寒治疗的首选抗生素。第三代头孢菌素抗菌活性强，对伤寒杆菌最小抑菌浓度多小于0.25ug/mL，而且胆汁浓度高，不良反应少，所以第三代头孢菌素也是伤寒治疗的首选药物之一。