对于月经周期不规律的患者，同样也有安全期，只是安全期的推算相对比较困难，所谓安全期，也就是月经排卵期前、后五天以外的时间。女性月经周期不规律，故安全期推算存在一定困难。对于大多数女性，月经周期为28-30天，可以推算排卵日期为下次月经前14日左右。如果月经周期不规律，下次月经来潮的时间不能确定，故排卵日期也就不容易确定。
对于月经周期不规律的女性，推算排卵日期可以根据基础体温的测定，或者B型超声监测卵巢内卵泡的排出情况确定排卵日期，从而推算出安全期。安全期的推算主要是用来避孕，安全期只是避孕的一种措施，不能作为常规的避孕方法。安全期主要是为了降低怀孕的几率，但是有的女性排卵日期会不规律，或者当次月经周期中没有排卵，也就不存在安全期和排卵期的可能。