孩子支原体感染，如果不吃药，自愈的可能性很小。孩子抵抗力相当强、比较壮实，小概率会自愈。不治疗时病情可能会迁延、反复，甚至加重。因为支原体通常会侵袭孩子的呼吸道黏膜，使呼吸道黏膜受损伤，导致气道分泌物增加，引起咳嗽。
严重的可能还会引起免疫反应，导致更为严重的器管功能损害。甚至出现呼吸系统之外，其他系统的临床症状，比如支原体脑炎、消化道症状等。所以支原体感染应该及时服药治疗，不能等待自愈，风险很大。