准分子治疗近视眼的后遗症，主要包括以下几个方面：
第一、干眼症：特别是在术前就有干眼症的患者，在术后干眼症的症状可能会明显加重。准分子激光治疗近视眼，主要是在角膜做相应的屈光手术，在角膜做切口或角膜制瓣，做角膜基质层的透镜取出，将角膜瓣复位。在这个手术过程当中，角膜有创，角膜的形态发生了改变，有可能就会影响到内膜的分布、稳定性，这样在术后引发干眼症，一般在术后按时滴用滴眼剂进行治疗，通过三个月到半年的治疗，干眼症的症状通常都能得到明显缓解。
第二、近视回退：准分子激光治疗近视眼手术以后有可能会发生近视回退，也就是再近视，这也是比较常见的后遗症，特别是对于术前近视度数没有稳定的患者比较容易发生，还有近视度数比较高，出现病理性近视。在术后如果发生再近视，可以考虑配戴眼镜来进行矫正，还可以考虑二次准分子激光手术进行治疗。