冷冻胚胎移植或者新鲜胚胎移植哪一个好，并不绝对。需要根据移植的时候患者的条件，这个条件要根据以下两方面的因素来选择：
第一、子宫内膜和胚胎发育的同步性，如果新鲜胚胎的时候子宫内膜发育提前或者迟后，也就是跟胚胎不同步，最好将胚胎冻起来，选择冷冻胚胎移植。而如果在新鲜周期中，子宫内膜和胚胎发育很好，没有不良禁忌症发生，新鲜胚胎移植会更好。还有种情况，如果有卵巢过度刺激综合征等高危因素，对于这种人来说也最好选择将胚胎冷冻，选择冻胚移植，以免鲜胚移植以后对妇女产生身体危害。
第二、如果胚胎进行了植入前遗传学诊断，也就是进行了胚胎活检。这种情况因为要等待活检的结果，也需要将胚胎冷冻，选择适当的时候待解冻胚胎进行移植。
所以冻胚移植和鲜胚移植需要根据具体的条件决定，没有太多的利弊，利弊是来自于胚胎或者就子宫内膜的条件而言。