肺炎克雷伯菌是一种阴性杆菌，可以导致肺炎、胆囊炎、泌尿系感染等多个部位的感染，甚至有时可以出现血流的感染。在临床当中，有少数的社区获得性肺炎可能是肺炎克雷伯杆菌感染所导致，此时可能会有咳嗽、咳痰、发热等相关症状，有时会出现典型的砖红色胶冻样痰，给予抗感染治疗，病人的病情可能会得到控制，但是严重者可以引起呼吸衰竭等并发症。
医院获得性感染包括肺炎、泌尿系感染等，肺炎克雷伯杆菌发生率可能会更高。对于医院获得性肺炎克雷伯杆菌感染，有时可能是耐药菌的感染，甚至可能会对大多数抗生素耐药，这种情况下治疗起来比较困难。肺炎克雷伯杆菌导致的血流感染可能累及多个脏器，可以导致肝脓肿、肺脓肿、脾脓肿，甚至可以导致眼内炎，此时病情也很凶险。