扁平疣用冷冻的方式治疗会有一定的效果，但是很难彻底根除，冷冻主要是利用液氮的极低温度，让表面的疣体组织快速冻伤、冻死，从而脱离正常的皮肤表面，达到治疗的效果。在冷冻的过程当中要注意以下几点：
1、液氮冷冻的过程比较痛苦，而且扁平疣一般比较密集，治疗的过程就会更加痛苦。
2、部分冷冻会引起小水疱。
3、如果冷冻过深，可能会导致后期有瘢痕遗留。
4、液氮冷冻并不能完全解决扁平疣复发的问题，可以尝试联合使用转移因子胶囊治疗。