男性尖锐湿疣的检查主要依靠外观临床表现来做诊断，因为尖锐湿疣多发生于龟头、冠状沟、包皮系带、尿道口、会阴、肛周，或者肛管内，在外生殖器的部位可以外观检查，就能看是否有尖锐湿疣。
如果没有表现出疣体，可以行醋酸白试验检测，病变组织变白，即可以诊断为亚临床感染。如果要是肛管内的尖锐湿疣，可以做肛诊或者下肛门镜检查。总之，能够看到明显的疣体，就可以做尖锐湿疣的诊断。