试管婴儿胎停育的原因，多数和自然受孕的胎停原因相当，主要包括以下几种：
第一、胚胎本身的染色体异常，导致胚胎停育，主要包括染色体的数目异常以及染色体缺陷。
第二、母体的原因所导致，子宫生长的环境导致出现胚胎停止发育，包括内分泌疾病、免疫性疾病等。
第三、环境的原因，环境问题主要是生活的环境出现电磁的污染，会对胎儿的生长发育产生一定的影响，
第四、孕妇本身精神过于紧张，或者剧烈运动，也会导致胚胎停止发育。
所以进行试管婴儿时，也有发生胚胎停育的可能，但是大部分原因和胚胎本身有关。而由于母体所造成的胚胎停育，经过积极的治疗，多数可以恢复正常。