颈椎按摩器可能会导致颈椎周围相关的软组织出现损伤，严重的可能会导致颈椎的肌肉出现内部的出血。还有可能会对颈椎的小关节造成不良影响，因为按摩器毕竟执行的是固定程序，所以在按摩的时候没有注重个体化治疗的原则，可能会导致颈椎小关节出现微小错位，甚至产生关节损伤。
还有可能会导致颈椎骨相关的损伤，比如如果患者将按摩器的位置安放错误，而且又使用了不正确的强度，强度过大可能会引起颈椎骨折或者骨折挫伤，严重的情况下可能会导致局部骨折错位，引起严重的并发症。