节段性肠炎是一种慢性病，病因目前还不是特别的明了，有人怀疑它的病因是病毒、细菌或是免疫的反应。从X射线照片可见，红肿发炎的肠管粗厚、充血，像嵌顿一样嵌满了斑驳的鹅卵石，这种炎症可以导致回肠的肠腔变得比较狭窄，引起痉挛或者疼痛。患者常常有腹泻和腹部的触痛，粪便也有可能带血或带黏液，因为这种节段性肠炎影响到人体的多个系统，所以最初的症状似乎与这种病无关。比如说发育障碍、口腔溃疡以及肌肉疼痛，都与节段性肠炎有关系。