强直性脊柱炎最早认为是一种多基因的遗传病，后来又研究认为是寡基因病。研究提示该病与MHCI类基因HLA-B27高度相关，迄今已发现89种以上的HLA-B27亚型，其中较多研究提示AS与B2704、B2705和B2702成正相关。因此，一般认为AS可能与泌尿生殖道沙眼衣原体、志贺菌、沙门菌和结肠耶尔森菌等某些肠道病原菌感染有关。