临床上发现的乙肝小三阳，绝大多数是肝功能持续保持正常，没有任何临床症状和体征的乙肝病毒携带者。绝大多数乙肝病毒携带者，暂时不需要治疗。需要治疗的小三阳，多是从携带者发展为慢性乙型肝炎，或者是转为肝纤维化，甚至肝硬化而成为小三阳患者。上述小三阳患者基本治疗是抗乙肝病毒治疗。目前抗乙肝病毒疗法分为两大类，包括干扰素注射疗法和核苷类似物口服疗法。干扰素疗法应用最多的是聚乙二醇干扰素，但是由于其副作用多、监测复杂而应用的较少。现在临床普遍应用的是口服核苷类似物抗病毒治疗，拉米夫定、阿德福韦酯、替比夫定现已不再推荐。目前推荐的一线核苷类似物有恩替卡韦、替诺福韦和丙酚替诺福韦。