男性小便时尿痛主要是由于泌尿系统感染，还有可能是由于异物，比如尿道的结石，也可以引起男性排尿时疼痛。一般情况下，要选择使用抗生素，比如吃头孢类的药物，如头孢克洛胶囊，或者喹诺酮类的药物，如环丙沙星类的药物。如果是泌尿系统的结石引起的尿痛，可以吃像排石散等，或者采用体外碎石，就可以使得尿痛治愈或者缓解。