黄连素是可以治疗肠炎的，黄连素治疗肠炎主要是针对细菌感染引起的肠炎。肠炎是因为腹部受凉或者进食不洁饮食等原因，导致肠道出现感染性病变。常见的感染包括有细菌、病毒、真菌，其主要表现是腹痛、腹泻、腹胀，部分会有发烧的现象。出现了肠炎，最好是化验血常规和大便常规，如果明确有细菌感染，可以考虑使用抗生素进行治疗，抗生素包括黄连素、左氧氟沙星、头孢类抗生素。所以黄连素在治疗细菌感染性的肠炎之中，有比较好的作用。
如果是病毒感染引起的肠炎，或者真菌感染引起的肠炎，或溃疡性结肠炎，黄连素效果并不是很明显。这些类型的肠炎可以通过对症处理，比如给予止泻的药物蒙脱石散等来止泻治疗，也可以给予调节肠道菌群的益生菌来进行治疗。同时可以口服补液盐来补充水电解质，防止脱水。所以肠炎的治疗，首先是要明确抗生素的类型和病因，然后选择相应的治疗药物。