毛发种植的手术几乎没有任何危险，但是任何手术都会发生出血和感染的风险，相应来说由于毛发种植主要是集中在头皮的浅层，出血量也不多，都可以通过相应的按压或者使用止血的药物来控制。如果出现感染的情况，主要是会影响毛囊的成活率，求美者只要回医院进行及时的清理，感染出血的情况都可以被积极控制住。
最主要风险就是毛发移植的毛囊成活率，没有预测的手术前那么好，就会影响毛发种植后的效果，所以求美者选择正规的医院进行毛发种植，才能减少这样的手术风险。同时，求美者应该在手术前进行详尽的术前检查，确定毛囊、毛发的健康状态，确定自身毛发的生长性状，可以通过种植进行改善，可以进行毛发移植的手术。