干扰素有抗病毒的作用，临床上外涂可以用来治疗扁平疣，但外用的药物因为浓度较低，所以疗效并不好，一般需要和维A酸类的药物联合使用。
一般干扰素外用一天四次左右，维A酸类药物，一般一天一次即可，疗程可能需要大概至少一个月，甚至2-3个月都有可能。
对于比较顽固的皮疹，也可以选择口服异维A酸类的药物，这类药物有抗表皮过度增殖、抗炎的作用。也可以选择外涂咪喹莫特乳膏，咪喹莫特可以起到调节局部免疫的作用，疗效较干扰素和维A酸要更好。