有卵巢囊肿怀孕了，是有风险的。生理性的黄素囊肿，就是妊娠期间发生的。怀孕以后，如果打算要的孩子就定期复查，如果不打算要的孩子，胚胎拿掉以后，囊肿可能随着体内激素水平的改变，生理性的囊肿就消失了。如果是病理性的卵巢黄素囊肿，如果囊肿比较小，可以定期复查，做肿瘤标志物检测。如果良性的，小于5.0cm可以继续观察。如果囊肿比较大，怀孕了是有风险的。囊肿比较大，警惕形成囊肿蒂扭转，形成妇科急腹症。所以，怀孕了且囊肿比较大，最好权衡利弊，先怀孕保守治疗，或把囊肿拿掉，再保胎对症治疗。以上内容仅供参考，具体用药、治疗请根据医生面诊指导为准。