黄连素能治疗肠炎，黄连素又名小檗碱，主要由黄连、黄柏和三棵针提取，也可人工合成。黄连素既往多作用于细菌性肠炎，近年有人联合其他药物用于保留灌肠，以治疗秋季腹泻，并取得良好的临床效果。研究表明，黄连素具有抗炎、免疫、调节的作用，其机制为作用于某些炎症细胞和炎症介质，可增加非特异性免疫功能，抑制特异性免疫作用。
黄连素不仅能在一定程度上抑制感染和炎症，还可作为一种作用肯定的钙离子拮抗剂，阻止胃肠道平滑肌的α受体，使受体控制的钙离子通道失活，抑制钙离子进入平滑肌细胞，促使回结肠水钠吸收，肠道内压力减低，减轻或抑制结肠黏膜的排便反射，阻断平滑肌兴奋，收缩耦联过程，从而解除胃肠平滑肌痉挛，并降低胃肠道压力，减慢肠蠕动，起到缓解腹痛、腹泻等胃肠炎症的作用。