急性睾丸炎由细菌感染引起，因此在治疗上是选择合适的抗生素，可以根据细菌培养的结果来选择敏感的抗生素，一般经验性的应用抗生素，主要是头孢类抗菌素静脉点滴，同时可以联合应用喹诺酮类抗菌素。如果不能排除支原体、衣原体感染，需要加用大环内酯类抗生素，通常静脉点滴控制症状以后，应当继续口服喹诺酮类药物2-4周。
其次就是选择一些针对缓解症状的药物，比如应用一些非甾体消炎镇痛药来解除疼痛症状，也可以应用一些止疼的药物，中医药制剂以及植物制剂可以发挥非特异性的抗炎作用，因此也可以在临床上应用。如果疾病进展出现脓肿，需要及时切开引流。