男婴肛周脓肿主要是因为肛窦损伤感染，肛窦损伤感染是引起肛周脓肿的主要原因。肛管腺开口于肛窦，肛窦开口向上呈漏斗状，肛腺管又直接通上肛门直肠周围间隙当中，所以粪便、异物、炎性分泌物容易继集，引发炎症。
还有男童因为骶尾骨弯曲没有形成，直肠和肛管呈垂直状，粪便容易压迫，也容易造成发炎。还有婴儿宝宝皮肤比较娇嫩，刚开始可能是一小粒，后面越来越严重变成化脓，如果不处理有些从皮肤外口破裂出来，还有些是从直肠破溃，就形成了肛瘘。
如果脓肿已经形成，摸上去有软化感，建议到医院及时切开排脓，排脓后尽量高锰酸钾坐浴，注意口服消炎药抗感染，还有外加百多邦涂。