病毒性丙型肝炎的主要治疗方法是抗病毒治疗，以往抗病毒治疗是应用干扰素和利巴韦林，目前由于小分子药物的问世，使治疗效果更好、疗程更短，而且治愈率更高。一般的小分子药物治愈率可以达到97%-99%。丙型肝炎抗病毒药物根据作为靶点的不同，可以分为以下几种：
1、蛋白酶抑制剂：如艾尔巴韦格拉瑞韦片、阿舒瑞韦软胶囊、伏西瑞韦片等。
2、NS5A抑制剂：有维帕他韦、来迪派韦索磷布韦片、盐酸达拉他韦片、格卡瑞韦哌仑他韦片等。
3、NS5B聚合酶抑制剂：有索磷布韦、达沙布韦等。
在临床治疗当中，要根据丙型肝炎基因分型、是否有合并肝硬化，以及是初治患者，还是经治患者，选择不同的药物进行治疗。总体治疗效果很好，绝大多数患者可以治愈，但针对已经发展为肝硬化或肝癌的患者则无法逆转。