男性阴囊小首先考虑是先天性隐睾，因为出生以后阴囊内没有睾丸，导致体积较小，需要通过后期的人工扩张并进行睾丸下降固定手术，可以恢复到正常状态，阴囊体积能够增大，但比正常男性阴囊仍然偏小。
其次，考虑是男性阴囊局部皮肤受到创伤，例如皮肤撕裂伤、烧伤等，是由于伤口加上愈合的过程中纤维瘢痕需要修复而导致阴囊体积缩小。
再次，考虑是男性的阴囊随着外界的温度发生改变，在寒冷的环境下尤其是冷水擦浴，容易造成阴囊皮肤收缩，导致阴囊腔变小，在环境温度高的情况下阴囊皮肤舒张，恢复到正常大小，属于正常的生理性调节。最后，男性在日常生活中要对阴囊做好护理，预防疾病出现。