精囊炎按病程可分为急性和慢性，病原体一般为大肠杆菌、变形杆菌和葡萄球菌等。精囊炎常与前列腺炎同时发生或相继发生，治疗上有一定的相似性。
对于急性精囊炎，可以选择广谱抗菌药物，比如头孢类药物，同时行尿培养，如培养有结果，及时调整为敏感药物，一般抗菌药物连续治疗2-3周。
慢性精囊炎可以用精液做细菌培养，但未必可以得到阳性结果，药物可以选择大环内酯类或喹诺酮类药物，比如阿奇霉素、左氧氟沙星。如果培养出病原菌，及时调整为敏感药物，疗程一般1-3个月。
除了抗菌药物外，还可以使用α受体阻滞剂改善症状，使用非甾体消炎药控制疼痛。另外，慢性精囊炎还可以使用热水坐浴、理疗等方法治疗。