蛲虫病最佳的治疗办法是用驱虫药治疗，可以快速有效地达到治愈效果。由于感染途径和生活习惯的特殊性，治疗需要重复1-2次，口服药物可以选择阿苯达唑。阿苯达唑可以顿服，隔两周重复一次。还可以选择甲苯达唑，主要是抑制虫体摄入葡萄糖，治愈率可以达到95%上。还可以应用抗虫啉，为广谱的驱虫药，通过抑制虫体胆碱酯酶，达到驱虫的作用，驱虫药短期治疗即可。
还可以外用药治疗，在便后或者是睡前用温水洗净肛门，再用含百部浸膏和甲紫的蛲虫软膏，通过细管挤入肛门内，可以阻止蛲虫的产卵，达到止痒和减少自身感染的目的。