治疗尖锐湿疣的药物可以选择鬼臼毒素酊，它一般适用于治疗直径小于10毫米的生殖器疣体，临床治愈率可以达到90%左右，用药疣体总面积不应该超过1平方厘米，日用量不应该超过0.5毫升，用药后应该待局部药物自然干燥，副作用以局部的刺激作用为主，可有瘙痒、灼痛、红肿、糜烂及坏死，还可以选择咪喹莫特霜治疗，尖锐湿疣疣体的清除率平均为56%，该疗法的特点为复发率低，约为13%，出现红斑不是停药指征，出现糜烂或破损需要停药并复诊，另外还可以选择三氯醋酸或者是二氯醋酸，需要医生实施操作治疗。