尿路感染吃左氧氟沙星或者阿莫西林，都有一定的治疗作用。左氧氟沙星和阿莫西林都属于广谱抗生素，但是侧重点略有不同。左氧氟沙星对多数的肠杆菌，比如大肠埃希菌、克雷伯菌、变形杆菌、沙门菌属都有很强的抗菌活性。对于淋病双球菌、金葡菌、肺炎链球菌、肺炎支原体、肺炎衣原体也有抗菌活性，但是对厌氧菌和肠球菌的作用相对较差。
对阿莫西林比较敏感的菌主要是链球菌属、脑膜炎球菌、沙门菌、钩端螺旋体、梅毒螺旋体等等，而大肠杆菌、变形杆菌、葡萄球菌、肺炎克雷伯杆菌、不动杆菌、支原体等等敏感性相对较差。因此左氧氟沙星在泌尿系感染当中应用相对更广一些，但是对左氧氟沙星过敏的患者可以考虑改服阿莫西林。对于青霉素过敏的患者则不宜服阿莫西林，考虑可以使用喹诺酮类的左氧氟沙星，因此两种药物有一定的互补作用。