莫匹罗星软膏可以涂在龟头上，主要用于治疗细菌感染引起的龟头炎，或者是混合感染龟头炎。莫匹罗星软膏对与皮肤感染有关的各种革兰氏阳性球菌有很强的抗菌活性，对耐药的金黄色葡萄球菌也有效，对某些革兰氏阴性菌同样具有一定抗菌作用，与其它抗生素并没有交叉的耐药性。
一般莫匹罗星软膏临床上用于治疗脓疱病、疖肿、毛囊炎等等原发性皮肤感染，以及湿疹合并感染、溃疡合并感染、创伤合并感染等继发皮肤感染。因此，细菌感染导致的龟头炎，出现红、肿、痒、痛、脓性分泌物等等，可以使用莫匹罗星软膏。同时配合清洗，不要喝酒，少吃辛辣、刺激的食物，治疗期间注意不要同房。