由于脂肪肝导致的转氨酶升高，绝大部分是不需要应用药物治疗的。虽然目前我国总人群脂肪肝发生率接近25%，也就是1/4的人口或轻或重的有脂肪肝，但只有相对较少的脂肪肝人群转氨酶升高，也就是达到了脂肪性肝炎的程度。这类转氨酶升高的脂肪肝，一大部分转氨酶都是轻度升高，通过增加体能锻炼、减轻体重、控制饮食、减少高热量饮食摄入、忌酒等使脂肪肝减轻或消失，转氨酶自然恢复正常。
只有转氨酶升高达到或超过正常值两倍以上，达到中度肝损伤的程度，临床上才适当给予保肝降酶药物。在用药的同时也需要进行饮食控制，适当锻炼及严格忌酒，常用的保肝降酶药物有水飞蓟宾、双环醇等，还可以给予中成药物，如肝爽颗粒。需要注意的是转氨酶恢复正常后仍要坚持控制饮食、控制体重、减少酒精摄入，才能长期控制转氨酶。