性腺发育不良大致分为三方面的原因：第一、染色体的问题，女性的是XX染色体，男性的是XY染色体，这两个性腺的染色体，决定性腺发育的染色体异常，比如有的人缺一条染色体，有的人多了一条Y染色体。第二、性腺发育的过程中需要一些物质，比如酶的缺乏会导致性腺发育异常。第三、染色体都没有异常，而性腺在母体发育过程中出现了异常，比如极端的早绝经，一个女孩在妈妈肚子里面，性腺刚开始发育，甚至还没开始发育，就已经绝经，也就是卵巢的功能衰竭了，表现为性腺发育不良。