头皮的毛囊炎主要是与头皮的皮脂分泌过多，毛囊、皮脂腺导管的堵塞，继发的细菌感染和炎症反应等有关。进入青春期以后，人体的雄激素水平，尤其是睾酮的水平升高，雄激素促进皮脂腺的增生、发育，并产生、分泌大量的皮脂。大量的皮脂淤积在毛囊、皮脂腺内，并刺激毛囊上皮细胞的角化过度，并与毛囊上皮细胞角化过度的细胞碎片混合堵塞毛囊管，导致皮脂排出障碍，形成角质栓，也就是微粉刺。
头皮的皮脂内化学成分的改变，造成皮肤表面的菌丛失调，某些细菌，例如痤疮丙酸杆菌和卵圆形糠秕孢子菌大量生长、繁殖，同时毛囊内的多种微生物的繁殖，尤其是痤疮丙酸杆菌大量繁殖，产生的游离脂肪酸侵蚀和破坏毛囊壁，而产生了炎症性、毛囊性的丘疹。某些局部因素，例如汗液的浸渍、脂垢腐败、分解、摩擦、理化刺激等又加重了炎症的反应，毛囊性的炎症进一步发展形成毛囊炎。局部的微生物感染，同时趋化炎症细胞和介质，最终诱导并加重了毛囊性炎症的反应。患者主要是抗菌素治疗，也可以外用含有抗真菌药物的洗发剂洗头，外涂过氧苯甲酰凝胶。