原发性血小板增多症是骨髓增殖性疾病的一种，也是骨髓造血干细胞的克隆性疾病。目前，原发性血小板增多症的治疗有以下几种：
一、口服化疗药，羟基脲治疗。应用羟基脲治疗，可以使患者的血小板恢复到正常，需要注意的是，羟基脲的长期应用，有可能造成第二肿瘤的发生。同时要根据患者的血色素和白细胞的计数，调整羟基脲的用量。由于羟基脲可以造成第二肿瘤的发生，在年轻的患者治疗时，需要慎重使用羟基脲。
二、采用干扰素的治疗，干扰素可以抑制巨核细胞的生成，抑制血小板生成时间的缩短，从而达到降低血小板的作用。主要是皮下注射，每次是300万U，一周应用3次。后期患者的血小板趋于正常时，可以根据个人情况适当的延长干扰素应用的频次。
三、一些原发性血小板增多症的患者可以伴有JAK-2基因的突变，可以应用JAK-2的抑制剂来治疗这一部分患者，达到靶向治疗的作用。为了防止由于血小板增高造成血栓的形成，可以应用一些阿司匹林、潘生丁、吲哚美辛，以及肝素等抗凝的药物，预防患者血栓的形成。