非典型鳞状上皮细胞意义不明确，是宫颈TCT检查报告结果中提出的一个比较重要的概念。这种情况主要见于既不能够诊断为感染、炎症、反应性改变，又不能诊断为癌前病变和恶性的鳞状上皮细胞，采用非典型鳞状上皮细胞不能明确意义进行诊断的描述。具体包括不典型化生细胞、不典型修复细胞、与萎缩有关的不典型鳞状上皮细胞、角化不良细胞，以及诊断HPV证据不足但暂时无法排除的患者。
诊断为非典型鳞状上皮细胞意义不明确，应该根据检查的标准、结果作为阴道镜检查的最低指征，也可以在液基细胞学检查的基础上检测高危型的HPV-DNA，对于诊断不典型鳞状上皮细胞不能明确意义时，应指出可能为炎症等反应，或可能为癌前病变，并且需要同时提出建议。如果与炎症、刺激、宫内节育环等反应性有关，应建议3-6个月复查，若可能为癌前病变或癌，但细胞学的异常程度不够诊断标准，应进行阴道镜活检。