导致牙龈萎缩的原因如下：
1、最常见的疾病有牙周病，在得牙周病的时候，在牙齿的颈部附着牙石，牙石上面有细菌，细菌分泌毒素或者酶类，使牙槽骨里面形成破骨细胞，破坏牙槽骨，使牙槽骨高度降低。牙槽骨高度降低后，上面附着的牙龈发生了退缩，出现牙龈萎缩，牙槽骨高度降低后，牙颈部暴露在口腔当中，牙颈部是牙齿比较薄弱的部位，有牙本质暴露，在遇到冷热刺激或者酸甜刺激时就会出现酸痛。
2、颌骨发育的问题或者牙齿位置的问题，也引起牙龈萎缩，常常是牙齿牙根特别靠近唇侧的骨板，或者唇侧骨板基本缺如，骨板缺失，牙龈会随之萎缩。
3、不正当的使用牙线或者刷牙，导致牙龈萎缩，牙齿酸痛。