抗食管癌的药物在临床当中种类比较多，常见的抗癌药物化疗药物包括替吉奥、氟尿嘧啶注射液、注射用紫杉醇、奥沙利铂以及伊立替康、注射用奈达铂、注射用多西他赛。这些是临床上比较常见，也是常年用于食管癌的一线化疗药物。
同时可以应用靶向药物，比如抗血管生成药物，主要有阿帕替尼、盐酸安罗替尼、重组人血管内皮抑制素注射液等对中晚期的食管癌效果比较理想。
新型的免疫治疗药物包括曲妥珠单抗以及中成药方面可以用华蟾素、消癌平等中药进行调节，其都有抗食管癌的效果。