引起肺部间质性改变的病因有很多，当然有一些是还没有明确、特发性，或者原因不明，还有一些继发性。最常见的几种原因，像是继发于其他疾病，比如结缔组织病或者血管炎，最常见的像干燥综合征、狼疮、皮肌炎，还有类风湿等疾病。还有环境因素，比如特殊粉尘的接触，特别是有机或者无机矿物质粉尘，像硅肺、尘肺都有可能引起间质性病变。
还有一些药物的因素，最常见的是胺碘酮，还有化疗药，比如博来霉素，一些靶向药，如吉非替尼都可能引起间质性改变。当然还有一部分病毒性感染，依然会有这种情况，都需要注意。