小儿脑萎缩的症状主要包括生长发育迟缓、运动神经功能发育迟缓、视觉和听觉发育障碍、吞咽困难以及牙齿发育障碍。大部分小儿脑萎缩的患儿都会表现为发育迟缓，和同龄的儿童比较，相对个子比较矮小或者发育不全。同时可能会有肌肉相对比较僵硬，肌张力比较高，运动不协调，共济功能障碍。视力障碍和听力障碍，主要表现为近视、斜视和听力减退。吞咽困难主要表现为咀嚼困难，口腔闭合困难，同时会有不自觉的流口水。大多数患儿都有牙齿发育障碍，牙齿质地比较疏松，容易有蛀牙。